O sistema de alerta tem como objetivo garantir que toda a população identificada na Zona de Autossalvamento seja notificada em caso de alguma emergência no barramento, testes audíveis ou simulações. É constituído por 10 estações remotas (sirenes), distribuídas nos municípios de Uberlândia e Araguari, sendo 05 a jusante do barramento da UHE Amador Aguiar I e 05 a jusante do barramento da UHE Amador Aguiar II.
Os principais componentes para funcionamento do sistema de Alerta, são: a Central de Monitoramento Remota (CMR); Central de Monitoramento e Operação Local (CMOL); e Sistema Irradiante de Transmissão e as Estações Remotas. As estações remotas emitem suas propagações sonoras (Mensagem de Voz e Sirene) simultaneamente, a partir do acionamento feito da Central de Monitoramento e Operação Local (CMOL) localizadas nas usinas do CCBE